- Monitoring of emerging viruses at the poultry-wildlife interface
- Studi su virus emergenti a livello di interfaccia uccelli domestici-fauna selvatica
- Graziosi, Giulia <1994>
Subject
- VET/05 Malattie infettive degli animali domestici
Description
- This thesis delves into the dynamics of pathogen transmission at the poultry-wildlife interface. Employing a multidisciplinary approach involving fieldwork, molecular biology techniques, sequence and phylogenetic analyses, and statistical analysis and modeling, these studies focus on significant poultry pathogens, namely avian influenza virus (AIV), avian metapneumovirus (aMPV), and infectious bursal disease virus (IBDV), within the context of their circulation in wild birds. A camera-trap survey conducted in Northern Italy enabled the identification of wild and domestic animal species frequenting the vicinity of poultry houses. The spatiotemporal patterns of these visits were thoroughly characterized, providing groundwork for the implementation of biosecurity measures to prevent pathogen spillover to poultry. In the same study area, a combination of sampling strategies and genomic analyses revealed 11 low pathogenic (LP) AIVs circulating in wild birds during the 2021-2022 AI epidemic in Italian poultry. While the role of wild birds in the AIV epidemiology has long been recognized, the involvement of free-ranging avifauna in the aMPV and IBDV transmission to poultry has been questioned. A systematic review and meta-analysis of aMPV in wild species identified the potential virus reservoirs or vectors, such as wild ducks, geese, gulls, and pheasants. Notably, the first detection of an aMPV subtype C virus in a novel migratory duck species, the Eurasian wigeon, further emphasized the likely wild duck’s role in aMPV-C virus circulation. Additionally, a systematic review and meta-analysis of IBDV prevalence in wild birds provided valuable insights into the virus’s epidemiology, although conclusive evidence on specific species' roles remains elusive. Overall, this thesis has offered novel insights for evidence-based epidemiological studies and targeted viral surveillance in wild hosts concerning AIV, aMPV and IBDV, avian viruses of great economic importance for the global poultry industry.
- Questo lavoro di tesi è stato concentrato sulle dinamiche di trasmissione di virus emergenti a livello di interfaccia tra uccelli domestici e fauna selvatica. Utilizzando un approccio multidisciplinare che ha incluso attività di campo, tecniche di biologia molecolare, analisi di sequenza e filogenetiche ed analisi statistiche avanzate, le attività di ricerca si sono focalizzate su tre fra i principali patogeni dei volatili domestici - il virus dell'influenza aviaria (AIV), il metapneumovirus aviare (aMPV) e il virus della bursite infettiva aviare (IBDV)-, considerandoli nel contesto della loro circolazione negli uccelli selvatici. Uno studio di video-trappolaggio condotto in tre allevamenti di galline ovaiole del Nord Italia ha permesso di identificare le specie di animali selvatici e domestici presenti in prossimità dei ricoveri. Nella stessa area di studio, 11 ceppi di AIV a bassa patogenicità sono stati rilevati in volatili acquatici selvatici, e caratterizzati mediante whole genome sequencing. Se il ruolo dei volatili selvatici nell'epidemiologia dell’influenza aviaria è ben noto, il coinvolgimento dell'avifauna nella trasmissione di aMPV e IBDV è tutt'ora oggetto di studio. Mediante revisione sistematica e meta-analisi della letteratura sulla prevalenza di aMPV in volatili selvatici, sono state identificate specie con un ruolo di potenziale serbatoio o vettore del virus, tra cui anatre selvatiche, oche, gabbiani e fagiani. Successivamente, mediante un'indagine epidemiologica su uccelli acquatici selvatici, per la prima volta è stato anche identificato e caratterizzato un aMPV sottotipo C in un fischione eurasiatico. Inoltre, una revisione sistematica e meta-analisi della letteratura sulla prevalenza di IBDV negli uccelli selvatici, ha riassunto le conoscenze sino ad ora acquisite sull'epidemiologia virale in questi ospiti. Per concludere, i risultati ottenuti nella presente tesi pongono le basi per lo svolgimento di nuovi studi epidemiologici e la eventuale messa a punto di programmi di sorveglianza in specie selvatiche target per AIV, aMPV e IBDV.
Date
- 2024-03-25
- info:eu-repo/date/embargoEnd/2025-02-15
Type
- Doctoral Thesis
- PeerReviewed
Format
- application/pdf
Identifier
urn:nbn:it:unibo-30277
Graziosi, Giulia (2024) Studi su virus emergenti a livello di interfaccia uccelli domestici-fauna selvatica, [Dissertation thesis], Alma Mater Studiorum Università di Bologna. Dottorato di ricerca in Scienze veterinarie