- Ruolo delle tecniche di sequenziamento di ultima generazione nella gestione dei pazienti con carcinoma colorettale metastatico
- Role of next generation sequencing technology in the management of patients with metastatic colorectal cancer
- Matteucci, Laura <1983>
Subject
- MED/06 Oncologia medica
Description
- L'utilità clinica dell’uso routinario delle tecniche di sequenziamento di nuova generazione (NGS) nei pazienti con cancro colorettale metastatico andrebbe approfondita. In questo studio, è stato valutato l'impatto di un pannello NGS da 52 geni utilizzato nella pratica clinica di routine. Abbiamo analizzato i risultati dei test molecolari multigenici in pazienti con carcinoma colorettale metastatico (mCRC) in uno studio osservazionale, retrospettivo e monocentrico su pazienti affetti da carcinoma colorettale metastatico consecutivamente testati presso un centro oncologico italiano tra giugno 2019 e dicembre 2020. Le analisi di sopravvivenza sono state effettuate con il metodo Kaplan-Meier, test log-rank e modello di Cox. Complessivamente sono stati inclusi 179 pazienti con mCRC. Il follow-up mediano è stato di 33 mesi (IQR: 28,45–NR). I quattro geni più frequentemente mutati sono stati: KRAS (48,6%), PIK3CA (22,4%), BRAF (14,5%) e APC (8,4%). È stata trovata un'associazione positiva tra la sopravvivenza globale (OS) e le mutazioni KRAS con un'alta frequenza allelica variante (VAF) [HR: 0,60 (0.36 – 0.99), P=0.047]. La mutazione BRAF era associata a OS inferiore [HR: 2,62 (1,59-4,32), P <0,001]. Il panello NGS ha consentito a otto pazienti di accedere a terapie a bersaglio molecolare non ancora registrate per il cancro colorettale. In conclusione, i pannelli NGS in mCRC sono fattibili nella pratica clinica in laboratori di riferimento per consentire un impatto inferiore sui costi e un aggiornamento regolare. La mutazione di BRAF risulta associata a una prognosi peggiore. Le mutazioni di KRAS con un’elevata variazione di frequenza allelica erano associate a una sopravvivenza globale superiore rispetto ai pazienti KRAS non mutati. Sono necessari studi più approfonditi per analizzare meglio i fattori prognostici.
- The clinical impact of targeted next-generation sequencing (NGS) in routine practice should be addressed in metastatic colorectal cancers. In this work, we studied the impact of a 52-gene amplicon-based NGS panel performed in routine practice. We analyzed the results of multigene molecular testing in metastatic colorectal cancer (mCRC) patients in a single-center, retrospective, observational study of consecutive mCRC patients tested at an Italian cancer centre between June 2019 and December 2020. Outcome was evaluated by the Kaplan–Meier method, log-rank tests and Cox models. Overall, 179 patients with mCRC were included. Median follow-up was 33 months (IQR: 28.45–NR). The four most frequently mutated genes were: KRAS (48.6%), PIK3CA (22.4%), BRAF (14.5%) and APC (8.4%). A positive association was found between overall survival and KRAS mutations with a high variant allele frequency (VAF) [HR: 0,60 (0.36 – 0.99), P=0.047]. BRAF mutation was associated with inferior overall survival (OS) [HR: 2.62 (1.59–4.32), P < 0.001]. The NGS panel enabled eight patients to access a targeted therapy not currently registered for mCRC. In conclusion, NGS panels in mCRC are feasible in reference laboratories for routine practice to allow for lower cost impact and regular updating. BRAF mutation is associated with a worse prognosis. Mutations in KRAS with a high VAF were associated with superior OS of mCRC patients compared with patients with KRAS wild-type tumors. In-depth studies are needed to better analyze the prognostic factors.
Date
- 2023-06-16
Type
- Doctoral Thesis
- PeerReviewed
Format
- application/pdf
Identifier
urn:nbn:it:unibo-29512
Matteucci, Laura (2023) Ruolo delle tecniche di sequenziamento di ultima generazione nella gestione dei pazienti con carcinoma colorettale metastatico, [Dissertation thesis], Alma Mater Studiorum Università di Bologna. Dottorato di ricerca in Oncologia, ematologia e patologia